"transfert" de paie?

bonjour, 

En aout, j'ai travaillé un moins en tant que vacataire dans une structure. Mon salaire devait ainsi être versé en deux fois : aout et septembre. En septembre j'ai signé un cdd avec la même structure sur un poste différent. Dans mon ancien contrat, je devais être payé avec un forfait à la journée. Sur mon nouveau contrat, je suis payé à l'heure. Au mois de septembre je devais percevoir la deuxième partie de ma rémunération du mois d'août + mon salaire du mois de septembre.

Voici ce qui m'interroge : D'après le responsable des paies, la trésorerie refusait de faire deux virements pour des postes différent sur le même compte. Du coup, le responsable des paies à "transféré" ce que la structure me devait au mois d'août sur mon salaire du mois de septembre comme heures supplémentaires ( contrat différent, pas même calculs des cotisations, pas le même statut, etc.). Je m'interroge sur la légalité de cette démarche.

De plus, sur l'attestation france travail, il n'est comptabilisé qu'une partie des jours que j'ai travaillé, soit les jours payés en août. Le reste des jours travaillés, qui devaient donc être payés en août mais ont étés transformés en heures sup que je n'ai pas faites, ne sont donc comptabilisés nulpart comme ce qu'ils sont réellement.

J'ai l'impression que tout ça est louche et mon employeur ne m'explique rien, il a fait cette démarche sans me consulter. Qu'en pensez-vous?