Incompréhension solde de tout compte suite RC

Bonjour, je viens de recevoir mon solde de tout compte et je n’y comprends rien. Il y a beaucoup de montants en négatifs. En effet, j’étais en CDI depuis 15/06/2020 et en arrêt maladie depuis le 12/08/2022. J’étais payée par la cgss et recevait que de très faibles montants par mon employeur. Suite à une rupture conventionnelle je reçois mon solde de tout compte et je m’aperçois que l’on me déduit mes absences de congés maladie alors que je n’avais pas été payé ? Pour être plus claire, sur mon dernier mois de salaire de 2450 brut, mon employeur a déduit 4030 d’absence maladie, je pars avec une base de solde tout compte négative. Du coup même en ayant des indemnités de rupture conventionnelle, le prorata des primes annuelles, les indemnités de congés payés, vu que mon ex employeur déduit les absences pour maladie, le montant de mon solde de tout compte a chuté. Je ne comprend pas qu’on me déduise mes absences maladie sur plusieurs périodes alors que mes fiches de paie des mois d’arrêt maladie laissent apparaître des salaires d’à peine 3 chiffres.