Solde tout compte negatif

Bonjour,

J ai signe un CDI le 17 mai 2022. Au 20 septembre j ai été en arrêt maladie puis congé maternité du 16 novembre au 7 mars. J ai à nouveau été en arrêt maladie du 7 mars au 30 juin. 
Le 30 mai j ai posé une lettre de démission ( avec préavis de 1 mois non effectué car en arrêt maladie).
J ai reçu mon solde tout compte et je dois 509,24 euro a mon employeur. 
Il est stipulé sur le courrier que compte tenu de mon arrêt maladie et du décalage des variables d un mois il apparaît un trop perçu.
Je n' arrive pas a comprendre..

salaire au point: 1607.58
prime fonctionnelle: 50.38
Complément au Smic: 139.66
Prime grand âge : 70
Prime ancienneté : 34.94
Indemnité dimanche : 141.06
Rappel indemnité dimanche mai 2023 : 141.06
Rappel indemnité jour férié mai 2023 : 56.43
Revalorisation Ségur : 238
Retenue absence maladie mai 2023 : - 2338.05
Retenue absence maladie juin 2023: - 2281.62
Heure normale a 100%: 119.19
Heure fériés: - 5.93
Indemnité compensatrice jours de récup : - 46.15
Iccp référence : 1263.47
Iccp en cours : 315.87
Pas juin: 15.86

Je précise que je n' ai pas eu droit au maintien de salaire. Je ne comprend pas les retenues d absences pour arrêt maladie. Mon employeur ne me paie pas car je ne suis pas présente dans l établissement je comprend sans problème mais je ne comprend pas pourquoi ces sommes sont déduites de mon soldes tout compte..

salaires brut: 
Du 17 mai au 30 mai : 995.19
Juin: 2019.00
Juillet: 2083.16
Août: 1478.71
Septembre: 1795.58
Octobre :1267 ( j étais en arrêt maladie depuis le 20 septembre)

Merci de vos éclaircissements. 

Marina