Négociation collective

Bonjour, je suis dans le flou et souhaiterais de l'aide.
Pour poser les bases je suis en CDI 39h sur 6jours dans une entreprise de grande distribution.
Nos heures supplémentaires ne sont pas payés car ils préfèrent que nous les récupérions.
Il y a 2 semaines je fût malade le mercredi (donc médecin et déclaré en arrêt de travail), le jeudi je suis revenu au travail même si j'étais KO pour pas les laisser dans la merde. Le vendredi et samedi complètement HS, rebelote je vais voir le doc, et fût en arrêt de travail. 
Mon directeur a imposé que mes 3 jours non consécutifs d'arrêt maladie soit rempli avec mes heures supplémentaires afin soit disant que je ne perde pas de salaire sur le mois...
A t'il le droit de m'imposer cela ? Alors que je suis en arrêt de travail ? Certe je ne toucherai rien de la sécurité sociale car je ne dépasse pas 3 jours de carence mais je trouve cela bizarre qu'il m'impose cela...
Si quelqu'un peu m'éclairer merci d'avance.